La Dirección de Administración Tributaria tiene por objeto la promoción del desarrollo y la correcta aplicación del Concierto Económico, y la coordinación, armonización y colaboración tributaria en el ámbito del Órgano de Coordinación Tributaria de Euskadi (OCTE). También corresponde a la Dirección de Administración Tributaria el asesoramiento, control y representación de la Administración General e Institucional de la Comunidad Autónoma en el cumplimiento de sus obligaciones tributarias, así como el diseño y desarrollo de sus tributos propios.

Así mismo, el Tribunal Económico Administrativo de Euskadi (TEAE), adscrito a la Dirección, es el órgano encargado de resolver las reclamaciones económico-administrativas contra los actos de contenido económico o de recaudación ejecutiva que procedan de órganos de la Administración General de la Comunidad Autónoma o de sus Organismos Autónomos.