La Viceconsejería de Infraestructuras y Movilidad Sostenible tiene encomendadas las funciones relativas a ordenación y planificación del transporte terrestre, marítimo, fluvial y por cable, movilidad de las personas, transporte de mercancías y logística e infraestructuras ferroviarias y viarias. Corresponde además a esta Viceconsejería ejercer la coordinación y control de las actividades desarrolladas por Euskal Trenbide Sarea y Euskotren.