La Dirección de Investigación, Innovación y Evaluación Sanitarias del Departamento de Salud se encarga de proponer, elevar y colaborar en la priorización de las políticas de investigación, innovación y evaluación en salud. También se dedica a la elaboración de estrategias, planes de actuación, y establecimiento de objetivos e indicadores para su seguimiento. Gestiona la actividad de I+D+i a través de entidades como la Fundación de Innovación e Investigación Sanitaria (BIOEF) y los cuatro Institutos de Investigación Sanitaria: Bioaraba, Biobizkaia, Biogipuzkoa, y Biosistemak. Fomenta la colaboración y sinergia con otros departamentos del Gobierno Vasco e instituciones públicas, así como la participación en iniciativas internacionales. Impulsa la cultura investigadora, formación y capacitación del personal, y promueve y financia proyectos de I+D+i. Facilita la transferencia y explotación de resultados de la investigación, gestiona estadísticas y documentos científicos, y coordina la investigación clínica con tecnologías sanitarias También evalúa y elabora informes de evaluación de tecnologías sanitarias en su ciclo de vida de cara a informar la decisión sobre su implantación, modificación de uso o eliminación de la provisión en el sistema de salud. Este enfoque integral facilita la toma de decisiones y el desarrollo de políticas eficientes en salud.