Azpiegitura eta Mugikortasun Jasangarriaren Sailburuordetzak honako eginkizun hauek ditu bere gain: lurreko, itsasoko, ibaietako eta kable bidezko garraioaren antolamendua eta plangintza; pertsonen mugikortasuna; salgaien garraioa eta logistika, eta trenbide eta bide- azpiegiturak. Sailburuordetza honi dagokio, gainera, Euskal Trenbide Sareak eta Euskotrenek burutzen dituzten jarduerak koordinatu eta kontrolatzea.