Garraio Plangintzaren Zuzendaritzak garatzen du Garraioaren Plangintzarako Programa, 2020-2024 aldirako Gobernu Programan ezarritako helburuak lortzeko asmoz. Horrela, garraioaren jasangarritasunaren arloan dituen herrialde mailako konpromisoei aurre egin nahi die, honako hauekin lotutako ekimenak barne: mugikortasun jasangarria, garraioen eta salgaien politika, aireportu-eredu integratua, plataforma logistikoak eta Euskadik Europako Arku Atlantikoan duen posizioa.
Horretarako, Garraio Plangintzaren Zuzendaritzak garraioaren arloko eskumenak jasotzen ditu lurreko, trenbideko, kable bidezko eta aireko garraioaren plangintzari dagokionez. Gainera, Euskotren tren-operadorearen tutoretza administratiboaz, bide-azpiegituren plangintzaren koordinazioaz eta errepideen araudi teknikoaz ere arduratzen da.