El Programa de Planificación del Transporte lo desarrolla la Dirección de Planificación del Transporte teniendo como finalidad la consecución de los objetivos marcados en el Programa de Gobierno 2020-2024 para, de esta manera, poder afrontar los compromisos de país en materia de sostenibilidad del transporte incluyendo las iniciativas asociadas a la movilidad sostenible, la política de transportes y mercancías, el modelo aeroportuario integrado, las plataformas logísticas y la posición de Euskadi en el Arco Atlántico Europeo.

Para ello, la Dirección de Planificación del Transporte recoge las competencias del área de Transportes en lo referente a planificación del transporte terrestre, por ferrocarril, cable y aéreo así como la tutela administrativa del operador ferroviario Euskotren y la coordinación de la planificación de infraestructuras viarias junto con la normativa técnica de carreteras.