La Viceconsejería de Relaciones Institucionales tiene entre sus funciones organizar los trabajos del Consejo de Gobierno, la publicación del BOPV, así como asistir a los Departamentos en sus relaciones con el Parlamento Vasco y el Ararteko. Desde una perspectiva más cercana a la ciudadanía, le corresponde el impulso y el desarrollo de procesos, instrumentos y servicios de información y atención general multicanal a la ciudadanía, el impulso de la transparencia, así como el fomento de la participación ciudadana en los asuntos públicos. También le corresponde el diseño del modelo de la Gobernanza Pública Vasca, así como el impulso y desarrollo de la innovación pública, la Administración electrónica y los servicios digitales. Otro de los ámbitos de actuación de la Viceconsejería tiene que ver con las relaciones con las entidades locales y las actuaciones en materia de administración local, así como las funciones relativas al régimen general, protectorado y registro que en materia de Fundaciones, Asociaciones y Colegios Profesionales.