La Dirección de Presupuestos se encarga anualmente de la elaboración de los Presupuestos Generales de Euskadi y el seguimiento de su ejecución, así como de la elaboración de los escenarios presupuestarios anuales, tanto de ingresos como de gastos, y los estudios e informes necesarios. Entre sus cometidos también figura el desarrollo de las directrices económicas y de las directrices técnicas por las que se guiará la confección de los anteproyectos de Presupuestos Generales y la coordinación y elaboración de la documentación que ha de acompañar al Proyecto de Ley de Presupuestos Generales de Euskadi.

Asimismo, se encarga de la emisión de los informes que correspondan en relación con las propuestas normativas, planes, convenios y acuerdos de contenido económico relevante a fin de evaluar el impacto presupuestario, prestando también asistencia técnica en las relaciones del Gobierno con el Parlamento en materia presupuestaria.